1984'te Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'ni bitirdi. 1985'te OMÜ İlahiyat Fakültesi Felsefe ve Din Bilimleri Bölümü Dinler Tarihi Anabilim Dalı'na Araştırma Görevlisi olarak girdi. 1989'da Durham Üniversitesi, School of Oriental Studies'de magister yaptı. 1991 Manchester Üniversitesi, Department of Middle Eastern Studies'de doktorasını tamamladı. 1995'te Dinler Tarihi Doçenti oldu. Dr. Şinasi Gündüz, dinler tarihi, karşılaştırmalı dinler, Gnostik inançlar, heterodoksal akımlar, mitoloji ve dinlerarası diyalog dersleri vermektedir. Merkezi Ankara’da bulunan Dinler Tarihi Derneği üyesidir.

a)    Kitaplar

1.     The Knowledge of Life. The Origins and Early History of the Mandaeans and Their Relation to the Sabians of the Qur’an and to the Harranians. Oxford University Press 1994.

2.     Ma'rifah al-Hayât: Dirâsât Havle Asli's-Sâbieti'l-Mandaiyyîn ve Târîhihim ve Alakâtihim bi Sâbieti'l-Kur'ân ve Harrâniyyîn. Çev. Sa'dî al-Sa'dî, Angered-Sweden: Merkezü'l-Harfi'-Arabî 1996 [The Knowledge of Life'ın Arapça çevirisi].

3.     Sâbiîler Son Gnostikler. Ankara: Vadi 1995 (geliştirilmiş ikinci basım 1999).

4.     Dinlerde Yükseliş Motifleri. (E. Sarıkçıoğlu ve Y. Ünal ile birlikte), Ankara: Vadi 1995.

5.     Din ve İnanç Sözlüğü. Ankara: Vadi 1998.

6.     Mitoloji ile İnanç Arasında. Ortadoğu Dinsel Gelenekleri Üzerine Yazılar. Samsun: Etüd 1998.

7.     Pavlus: Hıristiyanlığın Mimarı. Ankara: Ankara Okulu Yayınları 2001.

b) Makaleler

1.     “The Problems of the Nature and Date of Mandaean Sources” Journal for the Study of the New Testament 53 (1994): 87-97.

2.     “Arkeolojik Bulgular Işığında 2. yüzyıl Sumatar mar alahe Kültü” OMÜ İlahiyat Fakültesi Dergisi 6 (1992): 149-159.

3.     “Nag Hammadi Literatürü ve ‘Adem’in Vahyi’” OMÜ İlahiyat Fakültesi Dergisi 7 (1993): 93-125.

4.     “Esoterik Bilgi ve Kurtuluş Toplumu: Sâbiîler” Tezkire 7-8 (1994): 43-56.

5.     “Harranîlerde Peygamberlik ve ‘Harranlı Bâbâ’” İnsan Bilimleri Araştırmaları. Yeni Harran Çevresi 7-8 (1994): 3-16.

6.     “İslam’da Öteki’nin Bilimi: Kur’an’ın nasara Terimine Etimolojik ve Tarihsel Bir Yaklaşım” Tezkire 9-10 (1994-1995): 127-146.

7.     “Ay Tanrısı Sin Şehri: Harran. Tarihsel Bir Bakış” İnsan Bilimleri Araştırmaları. Yeni Harran Çevresi 9-10 (1995): 80-96.

8.     “Gnostik Mitolojide Düşüş Motifi ve Demiurg Düşüncesi” OMÜ İlahiyat Fakültesi Dergisi 9 (1997): 121-165.

9.     “Arkonların Tabiatı Üzerine” OMÜ İlahiyat Fakültesi Dergisi 9 (1997): 167-178.

10. "Gnostik Dinler", E. Sarıkçıoğlu: Başlangıçtan Günümüze Dinler Tarihi. Isparta 1999: 112-139.

11. "Kadim Ortadoğu'dan Orta Asya'ya Nevruz" Bilig 12 (2000): 1-15.

12. "Uluslararası Mandenler/Sâbiîler Konferansı" OMÜ İlahiyat Fakültesi Dergisi 11 (1999): 349-354.

13. "Pavlus Teolojisinde Gnostik Unsurlar" Dinî Araştırmalar 2 (2000) 6: 51-75.

14. "Tarihsel İsa ile İlgili Kaynaklar" Fecre Doğru 6 (2000) 61: 25-33.

15. "Çağdaş Hıristiyan Düşüncesinde Öteki'nin İnklusivist Yorumu" Tezkire 20 (2001): 91-116.

16. “İsalardan İsa Beğen: İsa Çeşitlemeleri –islâmiyât ‘İsa (as.) Anısına’ Özel Sayısı Üzerine-“, islâmiyât 4 (2001) 1: 181-190.

c) Tebliğler

1.     “Kur’an’daki Sâbiîlerin kimliği üzerine bir tahlil ve değerlendirme” Türkiye I. Dinler Tarihi Araştırmaları Sempozyumu (24-25 Eylül 1992). Samsun 1992: 43-81.

2.     “Senkretizm ve İslam düşüncesinin teşekkülü döneminde Gnostik geleneğin yeri” İslam Düşüncesi Sempozyumu (26-27 Ekim 1996). İstanbul 1996.

3.     “Cahiliye dönemi Arap politeizmine Nebatîlerin etkileri” Dinler Tarihi Araştırmaları I (Sempozyum: 08-09 Kasım 1996). Ankara 1998: 355-378.

4.     “Kur’an kıssalarının kaynağı Eski Ahit mi? Yapı, muhteva ve kaynak açısından Torah kıssaları” Kur’an Kıssalarının Anlam ve Değeri (IV. Kur'an Haftası Kur'an Sempozyumu). Ankara 1998: 41-75.

5.     “Sabiilerde Din ve Din Anlayışı” Dinler Tarihi Araştırmaları II (Sempozyum 20-21 Kasım 1998, Konya). Ankara 2000: 135-150.

6.     "Problems on the Muslim Understanding of the Mandaeans" (The Mandaeans, ARAM Thirteenth International Conference, Harvard University 13-15 June 1999) ARAM (published by Society for Syro-Mesopotamian Studies) 11-12 (1999-2000): 269-279.

7.     "Sinoplu Marcion'un Gnostik Teolojisi" Hoşgörü Yılı ve İnanç Turizminde Göller Bölgesi Sempozyumu, 07-08 Eylül 2000 Isparta Bildiriler Kitabı. Isparta 2001: 131-147.

8.     "Dinsel Zenginlik ve Kültürel Harmoni Bağlamında Harran ve Harraniler" Uluslararası Anadolu İnançları Kongresi Bildirileri, 23-28 Ekim 2000, Ürgüp/Nevşehir. Ankara 2001: 299-312.

9.     “Pavlus’un Hıristiyan Geleneğindeki Merkeziliği/Belirleyiciliği” 2000. Yılında Hıristiyanlık: Dünü, Bugünü ve Geleceği Sempozyumu. 9-10 Haziran 2001, Ankara.

10. “Hegemonic Power versus Tawhid: A Decisive Concept of Islam on Interfaith Relations” Uluslararası “Dünya Barışına Bir Katkı Olarak Dinler Arası Diyalog” Sempozyumu. 19-20 Haziran 2001, Samsun.

11. “Şeyh Adi ve Yezidilikte Gnostik Unsurlar” Uluslararası Türk Dünyası İnanç Önderleri Kongresi. 23-28 Ekim 2001, Ankara.

12. “Society and Culture in Harran During the Time of Thabit ibn Qurrah” Symposium on the Millennial Anniversary of Thābit ibn Qurrah, 2-3 November 2001, Al-Furqan Islamic Heritage Foundation, Wimbledon, London.